文献透视镜丨mNGS携手常规检测,高

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导语

年3月牛津大学临床研究室发表了关于mNGS在病毒性脑膜炎诊断的应用研究。该研究表明mNGS结合常规的血清学和PCR检测,可将临床的病毒性脑膜脑炎诊断性能明显提高，为mNGS组合拳诊断模式揭开了新的篇章。研究背景

病毒是脑膜脑炎的最常见病因，但许多病毒的检测具有挑战性，大于50％的患者使用当前的诊断技术未能确定病因，大多数常规诊断只可检测特定的病原体且数量有限，尤其是在检测条件有限的中低收入国家。而即使在设备齐全的实验室中，也仅有＜60％的患者中发现了致病性病毒。

近几年来，随着二代测序技术的发展，泛病原体的检测方法越来越多的用于已知和未知微生物的检测，特别是脑脊髓液（CSF）中病毒的灵敏检测。作者在美国进行了一项前瞻性研究，将常规检测的诊断性能与mNGS，以及二者结合应用的临床诊断率进行了比较评估，试图找到mNGS诊断病毒的最佳模式。一图看懂研究部分结果1、常规技术诊断效率低常规诊断在15/66（22.7％）位患者中发现了病毒。

2、mNGS的敏感性和特异性较高

mNGS在14/19CSF样本中通过PCR分析（包括常规诊断和扩展检测）鉴定出病毒病原体。在16/47例PCR阴性样品中检测到EV相关的读数。因此，以PCR为参考，mNGS的敏感性和特异性分别为74％（14/19）和66％(31/47)。

3、mNGS可改善常规方法的假阴性

常规诊断呈阴性的51个CSF样本中：mNGS在24个样本（48％）中发现了嗜神经性病毒相关的序列。检测到的病毒包括肠病毒（EV，n=23）和轮状病毒（n=1）。此外，2份阴性对照CSF样本，其中1份检出4个肠病毒相关的序列。进行PCR验证后，EV阳性的CSF数量从23个减少到7个。

4、联合检测可提高诊断率

由于常规PCR诊断未纳入病毒EV和MuV，为了进一步评估这些病毒的患病率，作者将PCR检测扩展至mNGS检测阴性的样品。因此，血清学和分子检测（PCR和mNGS）的组合将诊断率从22.7％（15/66）提高到了34.8％(23/66)。

图1DNA和RNA病毒mNGS和常规诊断及扩展pcr检测的研究结果对比

（缩写：DENV，登革热病毒；EV，肠病毒；HSV，单纯疱疹病毒；JEV，日本脑炎病毒；MuV，腮腺炎病毒；VZV，水痘带状疱疹病毒）

专家视点

由于日常临床医生没有将EV诊断视为常规护理的一部分，在66位患者中，最初在出院时未诊断出EV感染患者7例（11％）。提示，在患有脑膜脑炎的成人中，EV感染应被视为重要的鉴别诊断，应在进行mNGS分析之前排除。作为单一的泛病原检测方法，mNGS能够检测脑膜脑炎患者CSF样品中的多种嗜神经病毒，如结合其他检测手段，能更好的发挥mNGS的诊断能力，提高诊断率。

小编有感读完此文，小编深深感受到神经系统感染的复杂性。测试多种病原体对于最大化脑膜脑炎患者的诊断率至关重要。考虑到CSF样品有限，mNGS检测是一种非常有效的方法。所谓最英勇的战士也是有其软肋的，医院的常规诊断（血清学和PCR检测等），才是mNGS最好的打开方式。mNGS组合拳的方式可大大提高病毒性脑膜脑炎的诊断率，对于临床诊断及管理，特别是资源有限的地区具体很重要的意义。赛哲集团成立于年，专注于病原微生物检测服务——以病原微生物为核心目标，以感染性疾病为主要对象，以高通量测序技术为驱动核心，采用多种生物技术手段进行病原微生物的定性和定量检测，技术支持团队提供专业的临床解读服务，旨在成为专业从事微生物预防、诊断和精准治疗的集团化企业。

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