晓畅菌事第六期不再纠ldquo结

2021-2-28 来源:本站原创 浏览次数:

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病原高通量测序(mNGS)作为病原学检测的革命性的技术,已经在血流感染、呼吸道感染、中枢神经系统感染、局灶感染等方面体现出病原学诊断的有效性,其中,对结核病的鉴别诊断也显示出广阔的前景,本文总结了现有的mNGS对结核病诊断的临床研究,从不同的感染部位,对mNGS与Xpert、培养、抗酸染色等方法在检测的灵敏度、特异性、阳性预测值、阴性预测值、检测周期等方面进行了比较,希望为临床医生对结核病的诊断提供一些帮助。

本文亮点

根据现有的研究,mNGS对肺结核的诊断性能与Xpert相当,对结核性脑膜炎和骨关节结核的诊断远优于Xpert;

mNGS对肺结核的诊断周期远远短于传统方法(培养、抗酸染色和Xpert),且可以检测出结核分枝杆菌以外的感染;

经验性治疗前收集样本非常重要,因为抗结核治疗会显著降低mNGS的诊断效力。

结核病是传染病致死的首要原因,在世界范围内造成的死亡人数甚至超过了艾滋病和疟疾。结核病导致如此多人死亡的一个重要原因是诊断困难,预计40%的病例未能被发现和报告,Xpert于年得到世界卫生组织的认可。然而,它并没有提高全球病例检出率。由于结核病的快速和准确诊断是有效治疗的先决条件,因此临床迫切需要替代的快速筛查和诊断方法。mNGS作为一种近年来出现的一种病原学检测革命性的技术,已经在临床上体现出对结核病诊断有效性,下面是实践医学就mNGS对结核分枝杆菌诊断价值的研究现状的总结。

mNGS对肺结核的诊断性能与Xpert相当肺结核的非特异性症状通常会与常见的肺感染重叠,这可能会延误肺结核的诊断并增加相关的死亡,因此临床急需一种无需预判的的诊断方法,苏医院Zhang等人曾经评估了mNGS对于肺结核鉴别诊断的性能,研究发现mNGS检测的灵敏度为47.92%,与Xpert和培养相当(分别为45.83%和46.81%),但是远高于抗酸染色的29.17%,同时,mNGS体现出了对混合感染优异的诊断性能,mNGS鉴定出了14例非结核分枝杆菌感染、7例真菌感染和1例病毒感染,更为重要的是,mNGS在3天内鉴别出67.23%例感染,而传统方法(培养、抗酸染色和Xpert)在超过90天的时间内也仅仅鉴别了49.58%例感染。

图1mNGS、Xpert、培养、PCR以及抗酸染色对于肺结核鉴别诊断的性能(Zhang等人)

mNGS对结核性脑膜炎的诊断性能优于传统方式结核性脑膜炎的临床特性可能模仿其它其他脑膜脑炎,包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等引起的感染,这导致致病病原体确认的困难,医院关鸿志教授团队曾回顾性分析了培养、PCR和抗酸染色等常规检测和mNGS对结核分枝杆菌的诊断性能,研究结果表示:在明确诊断为结核分枝杆菌的患者中,mNGS、培养、抗酸染色、PCR对脑脊液样本首次检测的灵敏度分别为66.67%、33.33%、25%和8.33%,而各种方法的特异性均为%。如果将mNGS与传统方法结合,诊断率可以达到95.65%。

图2不同方法对结核性脑膜炎诊断性能比较(关鸿志等人)

医院Fan等人的研究同样显示出mNGS对结核性脑膜炎的高诊断率,根据他们的研究,mNGS对脑脊液检测的灵敏度可以达到84.44%,阳性预测值可以达到%,此外,ROC曲线显示脑脊液蛋白定量和脑脊液细胞计数对结核分枝杆菌阳性检测的预测有价值。

图3不同方法对结核性脑膜炎诊断性能比较(Fan等人)

mNGS对骨关节结核诊断能力优于Xpert医院Pang等人曾对82疑似骨关节感染患者的关节脓液进行了病原体培养、Xpert检测和mNGS检测的回顾性研究。其研究结果显示:mNGS确认了所有病例中的潜在病原体,其中结核分枝杆菌复合体最多,在mNGS检出的17例结核病例中,培养阳性的仅有10例,检出率为58.8%,Xpert的检出率为88.2%。值得注意的是,研究还表明使用培养成功检测所需的最少序列读数是10,而对于Xpert,相应检测限是3个序列数。

图4培养和Xpert检测对骨关节结核诊断性能的比较(Pang等人)

mNGS对多种样本结核分枝杆菌检出性能医院曾经开展了一项成人前瞻性研究,评价mNGS在多种样本中检测结核分枝杆菌复合体的诊断性能,结果表明mNGS对结核分枝杆菌诊断的敏感性为44%,与Xpert(42%)相似,但远高于常规方法(29%)。将Xpert和mNGS结合在一起确定了45例活动性结核病病例中的27例(60%),包括所有13例常规方法确定的病例。mNGS诊断性能因样本类型而异。在13例肺结核病例中,mNGS与Xpert灵敏度相同(62%),优于常规方法(38%)。在临床诊断为结核性脑膜炎患者的16份脑脊液样本中,mNGS的敏感性为44%,远高于Xpert(19%)和常规方法(19%)。此外,抗结核治疗显著降低了培养、Xpert和mNGS的诊断效力,这一结果突出了在经验性治疗前收集样本的重要性。肺结核活动性判别活动性判断作为肺结核诊疗工作中不可或缺的环节,主要解决肺结核“治不治疗”和“停不停药”的问题,根据最新出版的《肺结核活动性判断规范及临床应用专家共识》,病原学阳性的肺结核患者可直接判断为活动性。但对于病原学阴性的患者,在进行抗结核药物治疗前的活动性评价需要综合影像学、临床和实验室等方面进行判断。病原学阴性肺结核治疗前活动性临床综合评价流程见下图思考根据现有的研究结果,mNGS体现出了对肺结核、结核性脑膜炎以及骨关节结核感染等诊断的有效性,主要优势包括灵敏度高、检测周期短,检测的无偏性和全面性,是一种极具前景的结核病快速诊断工具。

参考文献

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